BitFaktura інтегрується з популярними сервісами та платформами: Prom.ua (синхронізація замовлень), Checkbox.ua (фіскалізація через ПРРО), WooCommerce, Sugester CRM, платіжні системи (PayPal, Stripe, Braintree, BitPay), SMS-сервіси (SMSAPI) та банківський імпорт. Також доступні API для власних інтеграцій та Multipass SSO для єдиного входу.