Для того, щоб періодичні рахунки-фактури виставлялися лише в робочі дні, достатньо додати новий періодичний рахунок-фактуру шляхом:

Рахунки-фактури (доходи) > Періодичні рахунки-фактури > Додати новий періодичний рахунок-фактуру, а потім встановіть прапорець "Виставляти лише в робочі дні".